Metodoxissa on kolme eri keskustelualuetta. Avoimet ja ilmaiset keskustelut käydään virtuaalikirjaston foorumissa. Sekin edellyttää rekisteröitymistä, mutta tämä rekisteröityminen on ilmainen.
Toinen keskustelualue koskee menetelmäartikkeleita, joista kullekin on luotu oma keskustelunsa. Keskustelun aiheina ovat luonnollisesti artikkelien esittelemät menetelmät ja lähestymistavat.
Kolmannet keskustelut käydään työryhmätasolla, jonne perustetaan metodikohtaisia kehittäjäyhteisöjä sitä mukaa, kun niihin herää tarvetta. Kullekin kehittäjäyhteisölle sovitaan asiantuntijavetäjä, joka ideaalitapauksessa on Metodixin menetelmäkirjoittaja.